Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms