Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10378F6XQQ1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm10378F6XQQ1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm10378F6XQQ1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm10378F6XQQ1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm10378F6XQQ1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm10378F6XQQ1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10378F6XQQ1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm10378F6XQQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10378F6XQQ1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm10378F6XQQ1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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