Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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