Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Atf6F6VAN0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6F6VAN0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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