Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28305F6U473 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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