Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms