Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms