Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc1E9Q043 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms