Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms