Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc17E9PVB5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms