Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms