Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc170D3YXL0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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