Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms