Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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