Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phf11cB4XVP9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms