Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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