Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms