Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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