Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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