Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn8B1ARD8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slfn8B1ARD8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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