Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms