Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms