Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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