Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GabreA2AMW3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms