Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ckap5A2AGT5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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