Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms