Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Akap17bA2A3V1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Akap17bA2A3V1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms