Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms