Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms