Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk1bQ9Z2C6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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