Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ilf3Q9Z1X4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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