Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms