Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N2

Orc1, Origin recognition complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc1Q9Z1N2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Orc1Q9Z1N2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Orc1Q9Z1N2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms