Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn13Q9Z0S4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms