Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn4Q9WU22 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn4Q9WU22 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms