Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trpc2Q9R244 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trpc2Q9R244 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trpc2Q9R244 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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