Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms