Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav3Q9R0C8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav3Q9R0C8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms