Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col4a3Q9QZS0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col4a3Q9QZS0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col4a3Q9QZS0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col4a3Q9QZS0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Col4a3Q9QZS0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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