Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms