Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms