Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Six6Q9QZ28 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms