Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms