Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms