Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc2lQ9JME7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms