Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnaja4Q9JMC3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms