Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rabgef1Q9JM13 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rabgef1Q9JM13 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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