Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Col5a3Q9JLI2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Col5a3Q9JLI2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms