Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms