Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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